Unterschiede

Hier werden die Unterschiede zwischen zwei Versionen angezeigt.

--- changelog_german [2009/11/12 12:57]
127.0.0.1 external edit
+++ changelog_german [2011/10/26 12:57] (aktuell)
ivomaintz
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+**__0.6__** in Arbeit
+  * Basis ist Xubuntu natty
+  * (erstmal) nur 64bit
+  * Umstieg auf xfce4 als Desktop Environment, da unity kein ordentliches Menü hat, sich schlecht bedienen läßt, viele Bugs hat und für große Bildschirme ungeeignet ist.
+  * Image liegt [[http://jaguar.biologie.hu-berlin.de/systems_biology/testing|hier]]
+  * Unsere Buildscripte etc. gibts über svn co [[http://jaguar.biologie.hu-berlin.de/svn/sbos/build/|http://jaguar.biologie.hu-berlin.de/svn/sbos/build/]]
+**__0.5__**
+  * SB.OS wird jetzt automatisch gebaut; auf lemur stößt ein Cronjob täglich um 6 den Neubau an, Samstags wird ein Image ins [[http://jaguar.biologie.hu-berlin.de/systems_biology/weekly/|Downloadverzeichnis]] kopiert.
+  * zwei Versionen: 32bit und 64bit
+  * Basis ist ubuntu maverick
+  * "Alles ist ein Paket", das klappt richtig gut... auch bei STSE u.ä.
+**__0.4.7__** in Arbeit
+  * viel getestet und geändert, vieles verworfen...
+  *
+//02.09.2010//
+  * arcadia 1.0r2, vmd 1.8.7 hinzugefügt
+**__0.4.6__**
+  * systems biology workbench Version 2.8.1, STSE funktioniert wieder aus dem Menü heraus, Kernelupdate.
+**__0.4.5__** ist fertig!
+  * Softwarestand siehe 0.4-beta4 oder auch http://www.sbos.eu/doku.php?id=software_included0.4.5
+  * Nur kleine Bugfixes: z.B. wird bei der Installation das SB.OS-Repo nicht mehr vergessen
+  * Ist hier auf 4 Rechnern im Einsatz; Einschränkung bei nachträglicher "Umwandlung" ist nur das Fehlen von OpenAlea sowie STSE. Beim derzeitigen Stand kann das nur manuell installiert werden (und dann auch nur unter 32bit)
+**__0.4-beta4__** in Arbeit
+  * Basis jetzt ubuntu lucid, neu aufgesetzt
+  * Neu dabei: 	Protégé http://protege.stanford.edu/, JSim http://www.physiome.org/jsim/, SQUAD http://www.enfin.org/wiki/doku.php?id=enfin:squad:start, BooleanNet http://code.google.com/p/booleannet/, PySCeS http://pysces.sourceforge.net/download.html, BioNetGen http://bionetgen.org/index.php/Documentation
+  * Updates: 	Celldesigner 4.1beta, BioModels 270410 (release 17), isatools-1.2, vanted-1.9, taverna-workbench-2.1.2
+  * libsbml-3.4.1 ist jetzt gesplittet (libsbml, libsbml-dev, libsbml-python, libsbml-java, libsbml-matlab)
+  * Umstellung auf amd64 geschafft; SB.OS kann prinzipiell in beiden Architekturen genutzt werden. Ausnahme: OpenAlea. Binaries gibt es nur in 32 bit, Kompilieren ist sehr kompliziert.
+  * Repository eingerichtet: einfach "deb http://jaguar.biologie.hu-berlin.de/sbos/ lucid main" in die /etc/apt/sources.lst eintragen, aptitude update, dann die gewünschten Programme installieren.
+    getestet mit Ubuntu lucid und karmic (da aber karmic in die sources.lst ...). Sollte mit anderen Debian-basierenden Distros auch gehen.
+  * Für die volle Packung: aptitude install sb.os-desktop
+**__0.4.3__** beta verfügbar; eventuell Probleme mit STSE und ATI-Grafik
+  * semanticSML-1.0.11
+  * Updates für STSE, Systemupdates u.v.a.
+**__0.3.5__** wir sind dabei...
+  * User ist sbos, nicht mehr ubuntu
+  * eine "eingeschränkte" Version für den Lehrbetrieb: der  automatisch eingeloggte User ist "sbos", hat keine administrativen Rechte und kann so die Festplatte nicht verändern, darf aber "externe" Datenträger benutzen
+  * semanticSBML-1.0.9
+  * TIde muß nicht mehr mit sudo laufen...
+  * Taverna, isa-tools installiert
+  * Basis auf ubuntu jaunty aktualisiert, wegen einiger Probleme neu aufgesetzt auf karmic- Basis am 06.11.09
+  * ModelMaGe aktualisiert auf 1.0beta, ins Menü eingetragen
+  * SBMLSqueezer aktualisiert auf 1.2.3
+  * neue BiNoM-Version (Plugin für Cytoscape)
+  * Cytoscape Version 2.6.3
+  * sundials cvode und serial solvers
+  * Edinbourgh Pathway Editor 1.3.0 integriert
+  * R 2.9.2
+  * Vanted 1.76
+  * SBML-PET 2.3.5
+  * Taverna 2.1 beta 2
+  * Systems Biology Workbench ist drauf
+  * STSE Editor und Viewer eingebaut, PlantGL geht wieder (libboost sei Undank)
+**__0.3.4__**
+  * Fehlerbereinigte TIde-Version 1.2.1 (Versionsnummer NICHT angepasst, sollte so bleiben)
+  * usplash-theme erstellt (usplash-theme-sbos 0.3.4)
+  * IMMER ANPASSEN: remaster-iso/isolinux/* und README.diskdefines. Besonders auf Datum/Bezeichnung achten!
+  * SBMLsqueezer 1.1 installiert
+  * Desktop/Licenses links repariert
+  * BioModels jetzt in /opt/Models/BioModels/, Doku angepasst, YeastNet- Models (jamboree) liegen unter /opt/Models/YeastNet/
+  * Menu-System "richtig" eingebunden: /etc/xdg/menus/SystemsBiology.menu und /etc/xdg/menus/applications-merged/SystemsBiology.merde.menu angelegt.
+  * semanticsbml-1.0.8, sbml2latex-0.9.7, sbmleditor-1.3.3 sind neu dabei
+  * Doku aktualisiert, neues Logo eingebaut.
+  * Update auf Kernel 2.6.27-14-generic, /boot/initrd*.gz nach ../../remaster-iso/casper/initrd.gz kopiert
+  * Endlich usplash angepasst: ein so kleiner Bug kann einen so lang beschäftigen: in file usplash-theme-sbos.c, line 53 change the '400' in '.pixmap = &pixmap_usplash_640_400,' to '480'
+  * gdm angepasst: gdm-sbos ist Standardthema
+  * Isolinux-Hintergrundbild: einfach remaster-iso/isolinux/splash.pcx und splash.png austauschen, 256 Farben gehen.
+  * Lizenz- Frage jetzt am Anfang der initrd, viel besser so...
+  * Ändern der Hintergrundfarbe (weiss) beim Start von X: in /etc/gdm.conf-custom "GraphicalThemedColor=#ffffff"
+  * displaySBML jetzt im Menü als sbml2latex
+  * SciTe (Editor), python-ply, ipython für pysces installiert, pysces läuft auch. Menüeintrag dafür?
+  * StarWars ist installiert (telnet towel.blinkenlights.nl)
+  * einige Fehlermeldungen in sbml2latex/latex werden durch das Kopieren des Verzeichnisses /usr/share/sbml2latex/src/resources/ in das Arbeitsverzeichnis behoben
+  * Cytoscape-2.6.2 und BiNom (keine Versionierung, wie's scheint) sind mit drauf, OpenAlea/VisuAlea aktualisiert
+  * SBOS 0.3.4 ist fertig!
+**__0.3.3__**
+  * Doku repariert (es fehlten die Videos!)
+  * ...und gstreamer0.10-plugins-ugly + gstreamer0.10-ffmpeg fehlten
+  * Visualea startet mit xterm wegen Bug: VisuAlea plottet nur, wenn es eus einem Terminal gestartet wird.
+**__0.3.2__**
+  * Geänderte config für semanticSBML, SemanticSBML- Daten nach /opt verschoben, da semanticsbml in der config nicht mit relativen Pfaden umgehen kann
+  * Doku und Optik von ubuntu4systemsbiology befreit
   * neu aufgesetzt am 01.05.2009, um ein entschlacktes system zu erhalten. Paketbau NICHT mehr in remaster-root, sondern auf anderen Maschinen (oder in /home/ivo/Dokumente/sysbuntu/remaster-root), um die DVD nicht zuzumumüllen.
   * celldesigner-4.0.1
@@ Zeile 31: / Zeile 127: @@
   * noch nicht in *.deb ausgelagerte eigene Anpassungen liegen momentan im "alten" sysbuntupfad unter usr/local/src/files4sbos
-  * **__0.3.2__**
-  * Geänderte config für semanticSBML, SemanticSBML- Daten nach /opt verschoben, da semanticsbml in der config nicht mit relativen Pfaden umgehen kann
-  * Doku und Optik von ubuntu4systemsbiology befreit
-  * **__0.3.3__**
-  * Doku repariert (es fehlten die Videos!)
-  * ...und gstreamer0.10-plugins-ugly + gstreamer0.10-ffmpeg fehlten
-  * Visualea startet mit xterm wegen Bug: VisuAlea plottet nur, wenn es eus einem Terminal gestartet wird.
-  * **__0.3.4__**
-  * Fehlerbereinigte TIde-Version 1.2.1 (Versionsnummer NICHT angepasst, sollte so bleiben)
-  * usplash-theme erstellt (usplash-theme-sbos 0.3.4)
-  * IMMER ANPASSEN: remaster-iso/isolinux/* und README.diskdefines. Besonders auf Datum/Bezeichnung achten!
-  * SBMLsqueezer 1.1 installiert
-  * Desktop/Licenses links repariert
-  * BioModels jetzt in /opt/Models/BioModels/, Doku angepasst, YeastNet- Models (jamboree) liegen unter /opt/Models/YeastNet/
-  * Menu-System "richtig" eingebunden: /etc/xdg/menus/SystemsBiology.menu und /etc/xdg/menus/applications-merged/SystemsBiology.merde.menu angelegt.
-  * semanticsbml-1.0.8, sbml2latex-0.9.7, sbmleditor-1.3.3 sind neu dabei
-  * Doku aktualisiert, neues Logo eingebaut.
-  * Update auf Kernel 2.6.27-14-generic, /boot/initrd*.gz nach ../../remaster-iso/casper/initrd.gz kopiert
-  * Endlich usplash angepasst: ein so kleiner Bug kann einen so lang beschäftigen: in file usplash-theme-sbos.c, line 53 change the '400' in '.pixmap = &pixmap_usplash_640_400,' to '480'
-  * gdm angepasst: gdm-sbos ist Standardthema
-  * Isolinux-Hintergrundbild: einfach remaster-iso/isolinux/splash.pcx und splash.png austauschen, 256 Farben gehen.
-  * Lizenz- Frage jetzt am Anfang der initrd, viel besser so...
-  * Ändern der Hintergrundfarbe (weiss) beim Start von X: in /etc/gdm.conf-custom "GraphicalThemedColor=#ffffff"
-  * displaySBML jetzt im Menü als sbml2latex
-  * SciTe (Editor), python-ply, ipython für pysces installiert, pysces läuft auch. Menüeintrag dafür?
-  * StarWars ist installiert (telnet towel.blinkenlights.nl)
-  * einige Fehlermeldungen in sbml2latex/latex werden durch das Kopieren des Verzeichnisses /usr/share/sbml2latex/src/resources/ in das Arbeitsverzeichnis behoben
-  * Cytoscape-2.6.2 und BiNom (keine Versionierung, wie's scheint) sind mit drauf, OpenAlea/VisuAlea aktualisiert
-  * SBOS 0.3.4 ist fertig!
-  * **__0.3.5__** wir sind dabei...
-  * User ist sbos, nicht mehr ubuntu
-  * eine "eingeschränkte" Version für den Lehrbetrieb: der  automatisch eingeloggte User ist "sbos", hat keine administrativen Rechte und kann so die Festplatte nicht verändern, darf aber "externe" Datenträger benutzen
-  * semanticSBML-1.0.9
-  * TIde muß nicht mehr mit sudo laufen...
-  * Taverna, isa-tools installiert
-  * Basis auf ubuntu jaunty aktualisiert, wegen einiger Probleme neu aufgesetzt auf karmic- Basis am 06.11.09
-  * ModelMaGe aktualisiert auf 1.0beta, ins Menü eingetragen
-  * SBMLSqueezer aktualisiert auf 1.2.3
-  * neue BiNoM-Version (Plugin für Cytoscape)
-  * Cytoscape Version 2.6.3
-  * sundials cvode und serial solvers

changelog_german.1258027077.txt.gz · Zuletzt geändert: 2009/11/13 13:07 (Externe Bearbeitung)

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