Unterschiede

Hier werden die Unterschiede zwischen zwei Versionen angezeigt.

Link zu dieser Vergleichsansicht

Beide Seiten der vorigen Revision Vorhergehende Überarbeitung
Nächste Überarbeitung
Vorhergehende Überarbeitung
Nächste Überarbeitung Beide Seiten der Revision
software_pending [2010/04/20 22:57]
falko
software_pending [2010/07/01 15:05]
ivomaintz
Zeile 1: Zeile 1:
 ====== Software higher priority ====== ====== Software higher priority ======
- 
-  * Protégé http://protege.stanford.edu/ 
-  * JSim http://www.physiome.org/jsim/ java based 
-  * LATEST release of BioModels Database curated models 
-  * SQUAD http://www.enfin.org/wiki/doku.php?id=enfin:squad:start 
-  * BooleanNet http://code.google.com/p/booleannet/ ist ein python paket, hab ich auch schon mit checkinstall installiert bekommen sollte also kein problem sein. networx abhängigkeit ist nich notwendig 
-  * Graphviz ist schon drauf oder? falls ja sollte es auf unsere list der installierten pakete das man das weiss 
-  * PySCeS http://pysces.sourceforge.net/download.html 
-  * BioNetGen http://bionetgen.org/index.php/Documentation 
  
 ====== Software lower priority ====== ====== Software lower priority ======
Zeile 20: Zeile 11:
   * Dizzy (last release in 2006)   * Dizzy (last release in 2006)
   * Virtual Cell http://www.nrcam.uchc.edu/ (requires internet connection!!!)   * Virtual Cell http://www.nrcam.uchc.edu/ (requires internet connection!!!)
-  * protege (ontology tool) 
   * YAMS Yet Another Mesoscopic Simulator (http://www2.hu-berlin.de/biologie/theorybp/wiki/pmwiki.php?n=Main.YAMS)   * YAMS Yet Another Mesoscopic Simulator (http://www2.hu-berlin.de/biologie/theorybp/wiki/pmwiki.php?n=Main.YAMS)
   * MesoRD http://mesord.sourceforge.net/ (outdated?)   * MesoRD http://mesord.sourceforge.net/ (outdated?)
Zeile 26: Zeile 16:
   * ByoDyn http://cbbl.imim.es:8080/ByoDyn/download (python tool for scanning parameter spaces)   * ByoDyn http://cbbl.imim.es:8080/ByoDyn/download (python tool for scanning parameter spaces)
   * Enthought Python Distribution sieht interessant aus, NAEHER ANSEHEN: http://www.enthought.com/products/epd.php   * Enthought Python Distribution sieht interessant aus, NAEHER ANSEHEN: http://www.enthought.com/products/epd.php
 +  * paxtools http://www.biopax.org/paxtools/
  
 ====== Models ====== ====== Models ======
 
software_pending.txt · Zuletzt geändert: 2011/09/28 23:44 von wolfliebermeister
Letzte Änderungen · Zeige Quelltext ·