====== Software higher priority ======

FASIMU for flux balance analysis
====== Software lower priority ======

  * SBRML lib (.NET based needs Mono) http://sbrml.sourceforge.net/SBRML/Welcome.html
  * SBGN: Arcadia (completly untested http://arcadiapathways.sourceforge.net/)
  * Javasim (http://sys-bio.org/sbwWiki/sbw/javasim) ???
  * E-cell System
  * SBML ODE Solver  (Christoph Flamm University of Vienna, Austria [[http://www.tbi.univie.ac.at/~raim/odeSolver/doc/api.html|www]] die haben auch iher eigene LiveCD gemacht, Debian based, mit tutorials, emial kontakt aufnehmen)   # funktioniert aber nur mit _alten_ Bibliotheken (libsbml u. sundials); trotzdem integrieren?
  * iBioSim (genetic networks)
  * Dizzy (last release in 2006)
  * YAMS Yet Another Mesoscopic Simulator (http://www2.hu-berlin.de/biologie/theorybp/wiki/pmwiki.php?n=Main.YAMS)
  * MesoRD http://mesord.sourceforge.net/ (outdated?)
  * smoldyn http://www.smoldyn.org/
  * ByoDyn http://cbbl.imim.es:8080/ByoDyn/download (python tool for scanning parameter spaces)
  * paxtools http://www.biopax.org/paxtools/

====== Models ======
  * BioCyc, EcoCyc, ...
  * JWS Online